2006年教育干部培训工作的指导思想是：以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面落实科学发展观，认真学习贯彻党的十六届五中全会和《干部教育培训工作条例（试行）》精神，紧紧围绕教育改革与发展的全局工作和中心任务，坚持以加强能力建设为重点，以制度建设为保证，以理论研究为依托，统筹规划、创新方法、拓宽途径，不断增强培训工作的针对性和实效性，努力开创教育干部培训工作的新局面。
2006年教育干部培训工作的主要任务如下：
一、全面规划“十一五”期间全国教育干部培训工作。按照中央关于大规模培训干部的总体部署，根据《干部教育培训工作条例（试行）》精神，切实加强教育干部培训工作的统筹规划、宏观指导和组织管理，制订《全国教育干部培训“十一五”规划》，并做好学习宣传和贯彻落实工作。
二、认真完成有关干部调训任务。落实全国组织部长会议精神，积极配合中组部、中宣部、中央党校落实2006年度干部调训计划，认真完成部领导，中央管理直属高校书记、校长，部机关和直属单位司局级领导干部以及有关中青年后备干部参加中央党校、中国浦东干部学院、中国井冈山干部学院、中国延安干部学院和国家行政学院培训的各项任务。制订中央管理高校领导干部2006至2010年参加政治理论脱产培训的计划。
三、认真抓好教育行政领导干部培训工作。以全面学习贯彻《中共中央国务院关于进一步加强和改进未成年人思想道德建设的若干意见》、《国务院关于大力发展职业教育的决定》、《国务院关于深化农村义务教育经费保障机制改革的通知》和《全国教育事业第十一个五年规划》精神为重点，根据不同的培训对象，举办一期省（自治区、直辖市）教育厅（教委）厅长（主任）高级研究班、两期地（市）教育局长（教委主任）研修班和两期县（市）教育局长培训班。
